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1.晴天污水截流
在暗渠或下游污水管网低水位条件下，晴天排水闸关闭，暗渠或管道污水通过合流制管道入截污井，自流至下游污水管道，下游管道水位较高时，通过井筒内的水泵根据井筒内水位自动启动并提升污水至处理设施，或提升至下游污水管，且可以防止河水倒灌，实现污水压力截流。
2.初雨限流
初雨时排水闸根据井内外水位调整开度，此时自动截污装置浮筒在浮力的作用下带动浮筒阀闸板逐步关闭截污管口，初期雨水也经由装置开口流向污水管网。截污闸根据水质及水位调整开度限流。
3.雨季直排
随着降雨增加，井内水位上升、水质浓度降低，到预设水位时，排水闸开始根据水位调整开度，向下打开，使上层污染较小水体溢出，同时截污闸逐渐减少开度截流量，降雨量达到一定值时，排水闸可以完全打开并关闭截污闸，雨水流入自然水体，从而实现雨水直排。
4.雨前排空
根据天气信息，在降雨前期，关闭截污闸启动潜污泵，动力提升排出污水，大限度减少合流管网中的污水，增加管网自身的调蓄空间，做到晴天时污水零直排。降雨开始，根据井内水质和井内外水位，控制水泵的启停和排水闸的开度。
5.降雨结束
随着现状合流管内水位下降，浮球感应信号，带动太阳能自控截污装置闸板逐步开启，并恢复到初始状态。
现在智能雨污分流井的使用范围是被人们认可的，它在水环境还是生态环境的方面都有着很好的运用。在城市建设中，雨污分流可以为一个城市的经济和环境带来好的影响，加快城市排水系统规划建设，能有效的解决城市污染带来的压力。